Protocole pour les mammifères

Protocole pour les oiseaux

Les contrôleurs embarqués effectuent un comptage exhaustif, quotidien et par espèce, des oiseaux présents autour du navire de pêche (attirés par les appâts et rejets usine de poissons notamment). Certaines espèces sont regroupées quand la distinction est impossible en mer (prions) ou en fonction de la distance (océanites, pétrels géants). L’objectif de l'observation scientifique des oiseaux de mer est d'estimer l'abondance des oiseaux et de noter leur interaction avec les opérations de pêche. Ceci peut permettre ensuite d'établir des distributions spatiales des principales espèces interagissant avec les navires de pêche.

Protocole pour les poissons

Les contrôleurs de pêche embarqués sur les navires récoltent des données à bord pour la gestion de la pêche et permettent aussi d’enrichir les connaissances scientifiques sur la zone. Différents protocoles sont réalisés à bords des navires par les contrôleurs de pêche embarqués.

Marquage et recapture

Le programme de marquage a débuté fin 2005 à Crozet et fin 2006 à Kerguelen. Techniquement il consiste à récupérer un poisson de la capture (noter la position géographique de la prise et faire les mesures biologiques), à lui fixer une marque dite ‘spaghetti’ (ou t-bar en anglais) au niveau de la nageoire dorsale et de remettre l’individu à l’eau. Lors de la recapture d’un individu marqué prendre de nouveau les mesures biologique et noter la position géographique de la recapture.

La mise en place d’un protocole de marquage/recapture a trois principaux objectifs : étude de la dynamique spatiale, estimation de l'abondance des espèces et de la croissance des poissons.

Biométrie

Pour les espèces cibles, mais aussi pour les espèces accessoires, une partie de la capture (échantillonnage aléatoire) est mesurée par les contrôleurs (taille, poids, sexe) permettant d’avoir une idée de la composition de la capture et d’effectuer les distributions de fréquences de tailles.

Otolithe

Les otolithes sont de petites concrétions calcaires (carbonate de calcium) de l’oreille interne des poissons, qui servent à son équilibre et composant mécanique de la conduction du son qui rend possible l'ouïe. La morphologie des otolithes peut être complexe et est strictement spécifique, ils peuvent dont être utilisés pour confirmer une identification. Les otolithes croissent tout au long de la vie du poisson en formant des anneaux reflétant une croissance rapide ou lente qui permet d'estimer l'âge des individus.

Le protocole d'acquisition des otolithes permet d'enrichir les collections pour toutes les espèces de poissons (notamment les plus rares) et la mise en place d'un programme de lecture d'âge pour la légine australe (Dissostichus eleginoides) pour intégration des données à la modélisation de stock favorisant ainsi la gestion de la pêcherie.

Barcoding

Afin d'augmenter la base de données génétiques des poissons de Kerguelen et Crozet, le protocole barcod a été mis en place. Ce protocole vise tous les poissons autres que les antimores, les raies et les grenadiers classiques et consiste à prélever un morceau de tissu sans graisse que l'on met en alcool dans un tube (ou à garder le spécimen entier dans le cas des Liparidae, Zoarcidae et plus généralement pour tous les très petits poissons). Le barcoding est utilisé pour valider des identifications d'espèces.

Protocole benthos

Les invertébrés benthiques sont les faunes structurantes des écosystèmes du fond marin. Cet ensemble, communément désigné par le terme générique « benthos », est composé de nombreux groupes taxonomiques.